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2022-09-03 22:05:03 +08:00

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32实操项目使用PyO3开发Python3模块

你好,我是陈天。

上一讲介绍了 FFI 的基本用法,今天我们就趁热打铁来做个实操项目,体验一下如何把 Rust 生态中优秀的库介绍到 Python/Node.js 的社区。

由于社区里已经有 PyO3 和 Neon 这样的工具,我们并不需要处理 Rust 代码兼容 C ABI 的细节,这些工具就可以直接处理。所以,今天会主要撰写 FFI shim 这一层的代码:

另外PyO3和Neon的基本操作都是一样的你会用一个另一个的使用也就很容易理解了。这一讲我们就以 PyO3 为例。

那么,做个什么库提供给 Python 呢?

思来想去,我觉得 Python 社区里可以内嵌在程序中的搜索引擎,目前还是一块短板。我所知道的 whoosh 已经好多年没有更新了,pylucene 需要在 Python 里运行个 JVM总是让人有种说不出的不舒服。虽然 Node.js 的 flexsearch 看上去还不错(我没有用过),但整体来说,这两个社区都需要有更强大的搜索引擎。

Rust 下,嵌入式的搜索引擎有 tantivy,我们就使用它来提供搜索引擎的功能。

不过tanvity 的接口比较复杂,今天的主题也不是学习如何使用一个搜索引擎的接口,所以我做了基于 tanvity 的 crate xunmi,提供一套非常简单的接口,今天,我们的目标就是:为这些接口提供对应的 Python 接口,并且让使用起来的感觉和 Python 一致

下面是 xunmi 用 Rust 调用的例子:

use std::{str::FromStr, thread, time::Duration};
use xunmi::*;

fn main() {
    // 可以通过 yaml 格式的配置文件加载定义好的 schema
    let config = IndexConfig::from_str(include_str!("../fixtures/config.yml")).unwrap();

    // 打开或者创建 index
    let indexer = Indexer::open_or_create(config).unwrap();

    // 要 index 的数据,可以是 xml / yaml / json
    let content = include_str!("../fixtures/wiki_00.xml");

    // 我们使用的 wikipedia dump 是 xml 格式的,所以 InputType::Xml
    // 这里wikipedia 的数据结构 id 是字符串,但 index 的 schema 里是 u64
    // wikipedia 里没有 content 字段,节点的内容($value相当于 content
    // 所以我们需要对数据定义一些格式转换
    let config = InputConfig::new(
        InputType::Xml,
        vec![("$value".into(), "content".into())],
        vec![("id".into(), (ValueType::String, ValueType::Number))],
    );

    // 获得 index 的 updater用于更新 index
    let mut updater = indexer.get_updater();
    // 你可以使用多个 updater 在不同上下文更新同一个 index
    let mut updater1 = indexer.get_updater();

    // 可以通过 add / update 来更新 indexadd 直接添加update 会删除已有的 doc
    // 然后添加新的
    updater.update(content, &config).unwrap();
    // 你可以添加多组数据,最后统一 commit
    updater.commit().unwrap();

    // 在其他上下文下更新 index
    thread::spawn(move || {
        let config = InputConfig::new(InputType::Yaml, vec![], vec![]);
        let text = include_str!("../fixtures/test.yml");

        updater1.update(text, &config).unwrap();
        updater1.commit().unwrap();
    });

    // indexer 默认会自动在每次 commit 后重新加载,但这会有上百毫秒的延迟
    // 在这个例子里我们会等一段时间再查询
    while indexer.num_docs() == 0 {
        thread::sleep(Duration::from_millis(100));
    }

    println!("total: {}", indexer.num_docs());

    // 你可以提供查询来获取搜索结果
    let result = indexer.search("历史", &["title", "content"], 5, 0).unwrap();
    for (score, doc) in result.iter() {
        // 因为 schema 里 content 只索引不存储,所以输出里没有 content
        println!("score: {}, doc: {:?}", score, doc);
    }
}

以下是索引的配置文件的样子:

---
path: /tmp/searcher_index # 索引路径
schema: # 索引的 schema对于文本使用 CANG_JIE 做中文分词
  - name: id
    type: u64
    options:
      indexed: true
      fast: single
      stored: true
  - name: url
    type: text
    options:
      indexing: ~
      stored: true
  - name: title
    type: text
    options:
      indexing:
        record: position
        tokenizer: CANG_JIE
      stored: true
  - name: content
    type: text
    options:
      indexing:
        record: position
        tokenizer: CANG_JIE
      stored: false # 对于 content我们只索引不存储
text_lang:
  chinese: true # 如果是 true自动做繁体到简体的转换
writer_memory: 100000000

目标是,使用 PyO3 让 Rust 代码可以这样在 Python 中使用:

好,废话不多说,我们开始今天的项目挑战。

首先 cargo new xunmi-py --lib 创建一个新的项目,在 Cargo.toml 中添入:

[package]
name = "xunmi-py"
version = "0.1.0"
edition = "2021"

[lib]
name = "xunmi"
crate-type = ["cdylib"]

[dependencies]
pyo3 = {version = "0.14", features = ["extension-module"]}
serde_json = "1"
xunmi = "0.2"

[build-dependencies]
pyo3-build-config = "0.14"

要定义好 lib 的名字和类型。lib 的名字,我们就定义成 xunmi这样在 Python 中 import 时就用这个名称crate-type 是 cdylib我们需要 pyo3-build-config 这个 crate 来做编译时的一些简单处理(macOS 需要)。

准备工作

接下来在写代码之前,还要做一些准备工作,主要是 build 脚本和 Makefile让我们能方便地生成 Python 库。

创建 build.rs并添入

fn main() {
    println!("cargo:rerun-if-changed=build.rs");
    pyo3_build_config::add_extension_module_link_args();
}

它会在编译的时候添加一些编译选项。如果你不想用 build.rs 来额外处理,也可以创建 .cargo/config然后添加

[target.x86_64-apple-darwin]
rustflags = [
  "-C", "link-arg=-undefined",
  "-C", "link-arg=dynamic_lookup",
]

二者的作用是等价的。

然后我们创建一个目录 xunmi再创建 xunmi/_init_.py添入

from .xunmi import *

最后创建一个 Makefile添入

# 如果你的 BUILD_DIR 不同,可以 make BUILD_DIR=<your-dir>
BUILD_DIR := target/release

SRCS := $(wildcard src/*.rs) Cargo.toml
NAME = xunmi
TARGET = lib$(NAME)
BUILD_FILE = $(BUILD_DIR)/$(TARGET).dylib
BUILD_FILE1 = $(BUILD_DIR)/$(TARGET).so
TARGET_FILE = $(NAME)/$(NAME).so

all: $(TARGET_FILE)

test: $(TARGET_FILE)
	python3 -m pytest

$(TARGET_FILE): $(BUILD_FILE1)
	@cp $(BUILD_FILE1) $(TARGET_FILE)

$(BUILD_FILE1): $(SRCS)
	@cargo build --release
	@mv $(BUILD_FILE) $(BUILD_FILE1)|| true

PHONY: test all

这个 Makefile 可以帮我们自动化一些工作,基本上,就是把编译出来的 .dylib 或者 .so 拷贝到 xunmi 目录下,被 python 使用。

撰写代码

接下来就是如何撰写 FFI shim 代码了。PyO3 为我们提供了一系列宏,可以很方便地把 Rust 的数据结构、函数、数据结构的方法,以及错误类型,映射成 Python 的类、函数、类的方法,以及异常。我们来一个个看。

将 Rust struct 注册为 Python class

之前在第 6 讲,我们简单介绍了函数是如何被引入到 pymodule 中的:

use pyo3::{exceptions, prelude::*};

#[pyfunction]
pub fn example_sql() -> PyResult<String> {
    Ok(queryer::example_sql())
}

#[pyfunction]
pub fn query(sql: &str, output: Option<&str>) -> PyResult<String> {
    let rt = tokio::runtime::Runtime::new().unwrap();
    let data = rt.block_on(async { queryer::query(sql).await.unwrap() });
    match output {
        Some("csv") | None => Ok(data.to_csv().unwrap()),
        Some(v) => Err(exceptions::PyTypeError::new_err(format!(
            "Output type {} not supported",
            v
        ))),
    }
}

#[pymodule]
fn queryer_py(_py: Python, m: &PyModule) -> PyResult<()> {
    m.add_function(wrap_pyfunction!(query, m)?)?;
    m.add_function(wrap_pyfunction!(example_sql, m)?)?;
    Ok(())
}

使用了 #[pymodule] 宏,来提供 python module 入口函数,它负责注册这个 module 下的类和函数。通过 m.add_function 可以注册函数,之后,在 Python 里就可以这么调用:

import queryer_py
queryer_py.query("select * from file:///test.csv")

但当时我们想暴露出来的接口功能很简单,让用户传入一个 SQL 字符串和输出类型的字符串,返回一个按照 SQL 查询处理过的、符合输出类型的字符串。所以为 Python 模块提供了两个接口 example_sql 和 query。

不过,我们今天要做的事情远比第 6 讲中对 PyO3 的使用复杂。比如说要在两门语言中传递数据结构,让 Python 类可以使用 Rust 方法等,所以需要注册一些类以及对应的类方法。

看上文使用截图中的一些代码(复制到这里了):

from xunmi import *

indexer = Indexer("./fixtures/config.yml")
updater = indexer.get_updater()
f = open("./fixtures/wiki_00.xml")
data = f.read()
f.close()
input_config = InputConfig("xml", [("$value", "content")], [("id", ("string", "number"))])
updater.update(data, input_config)
updater.commit()

result = indexer.search("历史", ["title", "content"], 5, 0)

你会发现,我们需要注册 Indexer、IndexUpdater 和 InputConfig 这三个类它们都有自己的成员函数其中Indexer 和 InputConfig 还要有类的构造函数。

但是因为 xunmi 是 xunmi-py 外部引入的一个 crate我们无法直接动 xunmi 的数据结构,把这几个类注册进去。怎么办?我们需要封装一下:

use pyo3::{exceptions, prelude::*};
use xunmi::{self as x};

#[pyclass]
pub struct Indexer(x::Indexer);

#[pyclass]
pub struct InputConfig(x::InputConfig);

#[pyclass]
pub struct IndexUpdater(x::IndexUpdater);

这里有个小技巧,可以把 xunmi 的命名空间临时改成 x这样xunmi 自己的结构用 x:: 来引用,就不会有命名的冲突了。

有了这三个定义,我们就可以通过 m.add_class 把它们引入到模块中:

#[pymodule]
fn xunmi(_py: Python, m: &PyModule) -> PyResult<()> {
    m.add_class::<Indexer>()?;
    m.add_class::<InputConfig>()?;
    m.add_class::<IndexUpdater>()?;
    Ok(())
}

注意,这里的函数名要和 crate lib name 一致,如果你没有定义 lib name默认会使用 crate name。我们为了区别crate name 使用了 “xunmi-py”所以前面在 Cargo.toml 里,会单独声明一下 lib name

[lib]
name = "xunmi"
crate-type = ["cdylib"]

把 struct 的方法暴露成 class 的方法

注册好Python的类继续写功能的实现基本上是 shim 代码,也就是把 xunmi 里对应的数据结构的方法暴露给 Python。先看个简单的IndexUpdater 的实现:

#[pymethods]
impl IndexUpdater {
    pub fn add(&mut self, input: &str, config: &InputConfig) -> PyResult<()> {
        Ok(self.0.add(input, &config.0).map_err(to_pyerr)?)
    }

    pub fn update(&mut self, input: &str, config: &InputConfig) -> PyResult<()> {
        Ok(self.0.update(input, &config.0).map_err(to_pyerr)?)
    }

    pub fn commit(&mut self) -> PyResult<()> {
        Ok(self.0.commit().map_err(to_pyerr)?)
    }

    pub fn clear(&self) -> PyResult<()> {
        Ok(self.0.clear().map_err(to_pyerr)?)
    }
}

首先,需要用 #[pymethods] 来包裹 impl IndexUpdater {},这样,里面所有的 pub 方法都可以在 Python 侧使用。我们暴露了 add / update / commit / clear 这几个方法。方法的类型签名正常撰写即可Rust 的基本类型都能通过 PyO3 对应到 Python使用到的 InputConfig 之前也注册成 Python class 了。

所以,通过这些方法,一个 Python 用户就可以轻松地在 Python 侧生成字符串,生成 InputConfig 类,然后传给 update() 函数,交给 Rust 侧处理。比如这样:

f = open("./fixtures/wiki_00.xml")
data = f.read()
f.close()
input_config = InputConfig("xml", [("$value", "content")], [("id", ("string", "number"))])
updater.update(data, input_config)

错误处理

还记得上一讲强调的三个要点吗在写FFI的时候要注意Rust的错误处理。这里所有函数如果要返回 Result<T, E>,需要使用 PyResult。你原本的错误类型需要处理一下变成 Python 错误。

我们可以用 map_err 处理,其中 to_pyerr 实现如下:

pub(crate) fn to_pyerr<E: ToString>(err: E) -> PyErr {
    exceptions::PyValueError::new_err(err.to_string())
}

通过使用 PyO3 提供的 PyValueError在 Rust 侧生成的 err会被 PyO3 转化成 Python 侧的异常。比如我们在创建 indexer 时提供一个不存在的 config

In [3]: indexer = Indexer("./fixtures/config.ymla")
---------------------------------------------------------------------------
ValueError                                Traceback (most recent call last)
<ipython-input-3-bde6b0e501ea> in <module>
----> 1 indexer = Indexer("./fixtures/config.ymla")

ValueError: No such file or directory (os error 2)

即使你在 Rust 侧使用了 panic!PyO3 也有很好的处理:

In [3]: indexer = Indexer("./fixtures/config.ymla")
---------------------------------------------------------------------------
PanicException                            Traceback (most recent call last)
<ipython-input-11-082d933e67e2> in <module>
----> 1 indexer = Indexer("./fixtures/config.ymla")
      2 updater = indexer.get_updater()

PanicException: called `Result::unwrap()` on an `Err` value: Os { code: 2, kind: NotFound, message: "No such file or directory" }

它也是在 Python 侧抛出一个异常。

构造函数

好,接着看 Indexer 怎么实现:

#[pymethods]
impl Indexer {
    // 创建或载入 index
    #[new]
    pub fn open_or_create(filename: &str) -> PyResult<Indexer> {
        let content = fs::read_to_string(filename).unwrap();
        let config = x::IndexConfig::from_str(&content).map_err(to_pyerr)?;
        let indexer = x::Indexer::open_or_create(config).map_err(to_pyerr)?;
        Ok(Indexer(indexer))
    }
    
    // 获取 updater
    pub fn get_updater(&self) -> IndexUpdater {
        IndexUpdater(self.0.get_updater())
    }

    // 搜索
    pub fn search(
        &self,
        query: String,
        fields: Vec<String>,
        limit: usize,
        offset: Option<usize>,
    ) -> PyResult<Vec<(f32, String)>> {
        let default_fields: Vec<_> = fields.iter().map(|s| s.as_str()).collect();
        let data: Vec<_> = self
            .0
            .search(&query, &default_fields, limit, offset.unwrap_or(0))
            .map_err(to_pyerr)?
            .into_iter()
            .map(|(score, doc)| (score, serde_json::to_string(&doc).unwrap()))
            .collect();

        Ok(data)
    }

    // 重新加载 index
    pub fn reload(&self) -> PyResult<()> {
        self.0.reload().map_err(to_pyerr)
    }
}

你看,我们可以用 #[new] 来标记要成为构造函数的方法,所以,在 Python 侧,当你调用:

indexer = Indexer("./fixtures/config.yml")

其实,它在 Rust 侧就调用了 open_or_crate 方法。把某个用来构建数据结构的方法,标记为一个构造函数,可以让 Python 用户感觉用起来更加自然。

缺省参数

最后来看看缺省参数的实现。Python 支持缺省参数,但 Rust 不支持缺省参数,怎么破?

别着急PyO3 巧妙使用了 Option当 Python 侧使用缺省参数时,相当于传给 Rust 一个 NoneRust 侧就可以根据 None 来使用缺省值,比如下面 InputConfig 的实现:

#[pymethods]
impl InputConfig {
    #[new]
    fn new(
        input_type: String,
        mapping: Option<Vec<(String, String)>>,
        conversion: Option<Vec<(String, (String, String))>>,
    ) -> PyResult<Self> {
        let input_type = match input_type.as_ref() {
            "yaml" | "yml" => x::InputType::Yaml,
            "json" => x::InputType::Json,
            "xml" => x::InputType::Xml,
            _ => return Err(exceptions::PyValueError::new_err("Invalid input type")),
        };
        let conversion = conversion
            .unwrap_or_default()
            .into_iter()
            .filter_map(|(k, (t1, t2))| {
                let t = match (t1.as_ref(), t2.as_ref()) {
                    ("string", "number") => (x::ValueType::String, x::ValueType::Number),
                    ("number", "string") => (x::ValueType::Number, x::ValueType::String),
                    _ => return None,
                };
                Some((k, t))
            })
            .collect::<Vec<_>>();

        Ok(Self(x::InputConfig::new(
            input_type,
            mapping.unwrap_or_default(),
            conversion,
        )))
    }
}

这段代码是典型的 shim 代码,它就是把接口包装成更简单的形式提供给 Python然后内部做转换适配原本的接口。

在 Python 侧,当 mapping 或 conversion 不需要时,可以不提供。这里我们使用 unwrap_or_default() 来得到缺省值(对 Vec 来说就是 vec![])。这样,在 Python 侧这么调用都是合法的:

input_config = InputConfig("xml", [("$value", "content")], [("id", ("string", "number"))])
input_config = InputConfig("xml", [("$value", "content")])
input_config = InputConfig("xml")

完整代码

好了,到这里今天的主要目标就基本完成啦。 xunmi-py 里 src/lib.rs 的完整代码也展示一下供你对比参考:

use pyo3::{
    exceptions,
    prelude::*,
    types::{PyDict, PyTuple},
};
use std::{fs, str::FromStr};
use xunmi::{self as x};

pub(crate) fn to_pyerr<E: ToString>(err: E) -> PyErr {
    exceptions::PyValueError::new_err(err.to_string())
}

#[pyclass]
pub struct Indexer(x::Indexer);

#[pyclass]
pub struct InputConfig(x::InputConfig);

#[pyclass]
pub struct IndexUpdater(x::IndexUpdater);

#[pymethods]
impl Indexer {
    #[new]
    pub fn open_or_create(filename: &str) -> PyResult<Indexer> {
        let content = fs::read_to_string(filename).map_err(to_pyerr)?;
        let config = x::IndexConfig::from_str(&content).map_err(to_pyerr)?;
        let indexer = x::Indexer::open_or_create(config).map_err(to_pyerr)?;
        Ok(Indexer(indexer))
    }

    pub fn get_updater(&self) -> IndexUpdater {
        IndexUpdater(self.0.get_updater())
    }

    pub fn search(
        &self,
        query: String,
        fields: Vec<String>,
        limit: usize,
        offset: Option<usize>,
    ) -> PyResult<Vec<(f32, String)>> {
        let default_fields: Vec<_> = fields.iter().map(|s| s.as_str()).collect();
        let data: Vec<_> = self
            .0
            .search(&query, &default_fields, limit, offset.unwrap_or(0))
            .map_err(to_pyerr)?
            .into_iter()
            .map(|(score, doc)| (score, serde_json::to_string(&doc).unwrap()))
            .collect();

        Ok(data)
    }

    pub fn reload(&self) -> PyResult<()> {
        self.0.reload().map_err(to_pyerr)
    }
}

#[pymethods]
impl IndexUpdater {
    pub fn add(&mut self, input: &str, config: &InputConfig) -> PyResult<()> {
        self.0.add(input, &config.0).map_err(to_pyerr)
    }

    pub fn update(&mut self, input: &str, config: &InputConfig) -> PyResult<()> {
        self.0.update(input, &config.0).map_err(to_pyerr)
    }

    pub fn commit(&mut self) -> PyResult<()> {
        self.0.commit().map_err(to_pyerr)
    }

    pub fn clear(&self) -> PyResult<()> {
        self.0.clear().map_err(to_pyerr)
    }
}

#[pymethods]
impl InputConfig {
    #[new]
    fn new(
        input_type: String,
        mapping: Option<Vec<(String, String)>>,
        conversion: Option<Vec<(String, (String, String))>>,
    ) -> PyResult<Self> {
        let input_type = match input_type.as_ref() {
            "yaml" | "yml" => x::InputType::Yaml,
            "json" => x::InputType::Json,
            "xml" => x::InputType::Xml,
            _ => return Err(exceptions::PyValueError::new_err("Invalid input type")),
        };
        let conversion = conversion
            .unwrap_or_default()
            .into_iter()
            .filter_map(|(k, (t1, t2))| {
                let t = match (t1.as_ref(), t2.as_ref()) {
                    ("string", "number") => (x::ValueType::String, x::ValueType::Number),
                    ("number", "string") => (x::ValueType::Number, x::ValueType::String),
                    _ => return None,
                };
                Some((k, t))
            })
            .collect::<Vec<_>>();

        Ok(Self(x::InputConfig::new(
            input_type,
            mapping.unwrap_or_default(),
            conversion,
        )))
    }
}

#[pymodule]
fn xunmi(_py: Python, m: &PyModule) -> PyResult<()> {
    m.add_class::<Indexer>()?;
    m.add_class::<InputConfig>()?;
    m.add_class::<IndexUpdater>()?;
    Ok(())
}

整体的代码除了使用了一些 PyO3 提供的宏,没有什么特别之处,就是把 xunmi crate 的接口包装了一下Indexer / InputConfig / IndexUpdater然后把它们呈现在 pymodule 中。

你可以去这门课的 GitHub repo 里,下载可以用于测试的 fixtures以及 Jupyter Notebookindex_wiki.ipynb

如果要测试 Python 代码,请运行 make,这样会编译出一个 release 版本的 .so 放在 xunmi 目录下,之后你就可以在 ipython 或者 jupyter-lab 里 from xunmi import * 来使用了。当然,你也可以使用第 6 讲介绍的 maturin 来测试和发布。

One more thing

作为一个 Python 老手,你可能会问,如果在 Python 侧,我要传入 *args变长参数 或者 **kwargs变长字典怎么办这可是 Python 的精髓啊别担心pyo3 提供了对应的 PyTuple / PyDict 类型,以及相应的宏。

我们可以这么写:

use pyo3::types::{PyDict, PyTuple};

#[pyclass]
struct MyClass {}

#[pymethods]
impl MyClass {
    #[staticmethod]
    #[args(kwargs = "**")]
    fn test1(kwargs: Option<&PyDict>) -> PyResult<()> {
        if let Some(kwargs) = kwargs {
            for kwarg in kwargs {
                println!("{:?}", kwarg);
            }
        } else {
            println!("kwargs is none");
        }
        Ok(())
    }

    #[staticmethod]
    #[args(args = "*")]
    fn test2(args: &PyTuple) -> PyResult<()> {
        for arg in args {
            println!("{:?}", arg);
        }
        Ok(())
    }
}

感兴趣的同学可以尝试一下(记得要 m.add_class 注册一下)。下面是运行结果:

In [6]: MyClass.test1()                                                                                                           
kwargs is none

In [7]: MyClass.test1(a=1, b=2)                                                                                                   
('a', 1)
('b', 2)

In [8]: MyClass.test2(1,2,3)                                                                                                      
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小结

PyO3 是一个非常成熟的让 Python 和 Rust 互操作的库。很多 Rust 的库都是通过 PyO3 被介绍到 Python 社区的。所以如果你是一名 Python 开发者,喜欢在 Jupyter Notebook 上开发,不妨把一些需要高性能的库用 Rust 实现。其实 tantivy 也有自己的 tantivy-py,你也可以看看它的实现源码。

当然啦,这一讲我们对 PyO3 的使用也仅仅是冰山一角。PyO3 还允许你在 Rust 下调用 Python 代码。

比如你可以提供一个库给 Python让 Python 调用这个库的能力。在需要的时候,这个库还可以接受一个来自 Python 的闭包函数,让 Python 用户享受到 Rust 库的高性能之外,还可以拥有足够的灵活性。我们之前使用过的 polars 就有不少这样 Rust 和 Python 的深度交互。感兴趣的同学可以看看它的代码。

思考题

今天我们实现了 xunmi-py按照类似的思路你可以试着边看 neon 的文档,边实现一个 xunmi-js让它也可以被用在 Node.js 社区。

欢迎在留言区分享讨论。感谢你的收听今天你完成了第32次Rust打卡啦继续坚持。我们下节课见