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# 15 | 数据源与数据格式:DataFrame从何而来?
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你好,我是吴磊。
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在上一讲,我们重点讲解了DataFrame与Spark SQL的渊源,并提到,DataFrame是Spark SQL的重要入口。换句话说,通过创建DataFrame并沿用DataFrame开发API,我们才能充分利用Spark SQL优化引擎提供种种“性能红利”。显然,对于初学者来说,第一步的创建DataFrame就变得至关重要。
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之前 [第13讲](https://time.geekbang.org/column/article/424550),我们做小汽车摇号倍率分析时,用了SparkSession的read API从Parquet文件创建DataFrame,其实创建DataFrame的方法还有很多。毫不夸张地说,DataFrame的创建途径异常丰富,为什么这么说呢?
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如下图所示,Spark支持多种数据源,按照数据来源进行划分,这些数据源可以分为如下几个大类:Driver端自定义的数据结构、(分布式)文件系统、关系型数据库RDBMS、关系型数据仓库、NoSQL数据库,以及其他的计算引擎。
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![图片](https://static001.geekbang.org/resource/image/f9/f6/f99dae173ba0268a8bd486ab200ecdf6.jpg?wh=1920x696 "Spark支持的数据源")
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显然,要深入地介绍Spark与每一种数据源的集成并不现实,也没必要,咱们只需要把注意力放在那些最常用、最常见的集成方式即可。
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这一讲,我会从Driver、文件系统与RDBMS三个方面,为你讲解5种常见的DataFrame创建方式,然后带你了解不同方式的使用场景跟优劣分析。
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## 从Driver创建DataFrame
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在Driver端,Spark可以直接从数组、元组、映射等数据结构创建DataFrame。使用这种方式创建的DataFrame通常数据量有限,因此这样的DataFrame往往不直接参与分布式计算,而是用于辅助计算或是数据探索。尽管如此,学习这部分知识点还是非常必要的,因为它可以帮我们更直观地理解DataFrame与RDD的关系。
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还记得吗?在数据表示(Data Representation)上,相比RDD,DataFrame仅仅是多了一个Schema。甚至可以说,DataFrame就是带Schema的RDD。因此,创建DataFrame的第一种方法,就是先创建RDD,然后再给它“扣上”一顶Schema的“帽子”。
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从本地数据结构创建RDD,我们用的是SparkContext的parallelize方法,而给RDD“扣帽子”,我们要用到SparkSession的createDataFrame方法。
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### createDataFrame方法
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为了创建RDD,我们先来定义列表数据seq。seq的每个元素都是二元元组,元组第一个元素的类型是String,第二个元素的类型是Int。有了列表数据结构,接下来我们创建RDD,如下所示。
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```scala
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import org.apache.spark.rdd.RDD
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val seq: Seq[(String, Int)] = Seq(("Bob", 14), ("Alice", 18))
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val rdd: RDD[(String, Int)] = sc.parallelize(seq)
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```
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有了RDD之后,我们来给它制作一顶“帽子”,也就是我们刚刚说的Schema。创建Schema,我们需要用到Spark SQL内置的几种类型,如StructType、StructField、StringType、IntegerType,等等。
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其中,StructType用于定义并封装Schema,StructFiled用于定义Schema中的每一个字段,包括字段名、字段类型,而像StringType、IntegerType这些\*Type类型,表示的正是字段类型。为了和RDD数据类型保持一致,Schema对应的元素类型应该是(StringType,IntegerType)。
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```scala
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import org.apache.spark.sql.types.{StringType, IntegerType, StructField, StructType}
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val schema:StructType = StructType( Array(
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StructField("name", StringType),
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StructField("age", IntegerType)
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))
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```
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好啦,到此为止,我们有了RDD,也有了为它量身定做的“帽子”Schema。不过,在把帽子扣上去之前,我们还要先给RDD整理下“发型”。这是什么意思呢?
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createDataFrame方法有两个形参,第一个参数正是RDD,第二个参数是Schema。createDataFrame要求RDD的类型必须是RDD\[Row\],其中的Row是org.apache.spark.sql.Row,因此,对于类型为RDD\[(String, Int)\]的rdd,我们需要把它转换为RDD\[Row\]。
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```scala
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import org.apache.spark.sql.Row
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val rowRDD: RDD[Row] = rdd.map(fileds => Row(fileds._1, fileds._2))
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```
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“发型”整理好之后,我们就可以调用createDataFrame来创建DataFrame,代码如下所示。
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```scala
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import org.apache.spark.sql.DataFrame
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val dataFrame: DataFrame = spark.createDataFrame(rowRDD,schema)
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```
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DataFrame创建好之后,别忘了验证它的可用性,我们可以通过调用show方法来做简单的数据探索,验证DataFrame创建是否成功。
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```scala
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dataFrame.show
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/** 结果显示
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+----+---+
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| name| age|
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+----+---+
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| Bob| 14|
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| Alice| 18|
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+----+---+
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*/
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```
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历尽千辛万苦,我们先是用Driver端数据结构创建RDD,然后再调用createDataFrame把RDD转化为DataFrame。你可能会说:“相比用parallelize创建RDD,用createDataFrame创建DataFrame的方法未免复杂了些,有没有更简便的方法呢?”我们接着往下看。
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### toDF方法
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其实要把RDD转化为DataFrame,我们并不一定非要亲自制作Schema这顶帽子,还可以直接在RDD之后调用toDF方法来做到这一点。咱们先来看toDF函数的用法,然后再去分析,spark.implicits是如何帮我们轻松创建DataFrame的。
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```scala
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import spark.implicits._
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val dataFrame: DataFrame = rdd.toDF
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dataFrame.printSchema
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/** Schema显示
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root
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|-- _1: string (nullable = true)
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|-- _2: integer (nullable = false)
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*/
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```
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可以看到,我们显示导入了spark.implicits包中的所有方法,然后通过在RDD之上调用toDF就能轻松创建DataFrame。实际上,利用spark.implicits,我们甚至可以跳过创建RDD这一步,直接通过seq列表来创建DataFrame。
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```scala
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import spark.implicits._
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val dataFrame: DataFrame = seq.toDF
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||
dataFrame.printSchema
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||
/** Schema显示
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||
root
|
||
|-- _1: string (nullable = true)
|
||
|-- _2: integer (nullable = false)
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||
*/
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```
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是不是感觉这个方法很简洁、很轻松?不过,你可能会问:“既然有toDF这条捷径,一开始干嘛还要花功夫去学步骤繁琐的createDataFrame方法呢?”
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网络上流行过这么一句话:“你的岁月静好,是有人在背后帮你负重前行。”toDF也是同样的道理,我们之所以能用toDF轻松创建DataFrame,关键在于spark.implicits这个包提供了各种隐式方法。
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隐式方法是Scala语言中一类特殊的函数,这类函数不需要开发者显示调用,函数体中的计算逻辑在适当的时候会自动触发。正是它们在背后默默地帮我们用seq创建出RDD,再用createDataFrame方法把RDD转化为DataFrame。
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## 从文件系统创建DataFrame
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说完第一类数据源,接下来,我们再来看看Spark如何从文件系统创建DataFrame。
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Spark支持多种文件系统,常见的有HDFS、Amazon S3、本地文件系统,等等。不过无论哪种文件系统,Spark都要通过SparkSession的read API来读取数据并创建DataFrame。所以接下来,我们需要先弄明白read API要怎样使用,都有哪些注意事项。
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read API由SparkSession提供,它允许开发者以统一的形式来创建DataFrame,如下图所示。
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![图片](https://static001.geekbang.org/resource/image/52/43/525441865dede68fa5a9138cb930de43.jpg?wh=1920x654 "read API统一入口")
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可以看到,要使用read API创建DataFrame,开发者只需要调用SparkSession的read方法,同时提供3类参数即可。这3类参数分别是文件格式、加载选项和文件路径,它们分别由函数format、option和load来指定。
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先来看第1类参数文件格式,它就是文件的存储格式,如CSV(Comma Separated Values)、Text、Parquet、ORC、JSON。Spark SQL支持种类丰富的文件格式,除了这里列出的几个例子外,Spark SQL还支持像Zip压缩文件、甚至是图片Image格式。
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完整的格式支持,你可以参考下图,或是访问[官网给出的列表](https://docs.databricks.com/data/data-sources/index.html)。在后续的讲解中,我们还会挑选一些常用的数据格式来演示read API的具体用法。
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![图片](https://static001.geekbang.org/resource/image/3c/e2/3c0751be7a5cyya43025cf51f4c7cce2.jpg?wh=1920x406 "read API支持的数据格式")
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文件格式决定了第2类参数加载选项的可选集合,也就是说,不同的数据格式,可用的选型有所不同。比如,CSV文件格式可以通过option(“header”, true),来表明CSV文件的首行为Data Schema,但其他文件格式就没有这个选型。之后讲到常见文件格式用法时,我们再对其加载选项做具体讲解。
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值得一提的是,加载选项可以有零个或是多个,当需要指定多个选项时,我们可以用“option(选项1, 值1).option(选项2, 值2)”的方式来实现。
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read API的第3类参数是文件路径,这个参数很好理解,它就是文件系统上的文件定位符。比如本地文件系统中的“/dataSources/wikiOfSpark.txt”,HDFS分布式文件系统中的“hdfs://hostname:port/myFiles/userProfiles.csv”,或是Amazon S3上的“s3://myBucket/myProject/myFiles/results.parquet”,等等。
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了解了read API的一般用法之后,接下来,我们结合一些常见的数据格式,来进行举例说明。对于那些在这节课没有展开介绍的文件格式,你可以参考[官网给出的用法](https://docs.databricks.com/data/data-sources/index.html)来做开发。
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### 从CSV创建DataFrame
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以可读性好的纯文本方式来存储结构化数据,CSV文件格式的身影常见于数据探索、数据分析、机器学习等应用场景。经过上面的分析,我们知道,要从CSV文件成功地创建DataFrame,关键在于了解并熟悉与之有关的加载选项。那么我们就来看看,CSV格式都有哪些对应的option,它们的含义都是什么。
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![图片](https://static001.geekbang.org/resource/image/ba/7d/baa646d5c88322e88376d905573f4a7d.jpg?wh=1920x943 "CSV格式常用的option选项")
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从上往下看,首先是“header”,header的设置值为布尔值,也即true或false,它用于指定CSV文件的首行是否为列名。如果是的话,那么Spark SQL将使用首行的列名来创建DataFrame,否则使用“\_c”加序号的方式来命名每一个数据列,比如“\_c0”、“\_c1”,等等。
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对于加载的每一列数据,不论数据列本身的含义是什么,Spark SQL都会将其视为String类型。例如,对于后面这个CSV文件,Spark SQL将“name”和“age”两个字段都视为String类型。
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```scala
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name,age
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alice,18
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bob,14
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```
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```scala
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import org.apache.spark.sql.DataFrame
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val csvFilePath: String = _
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val df: DataFrame = spark.read.format("csv").option("header", true).load(csvFilePath)
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// df: org.apache.spark.sql.DataFrame = [name: string, age: string]
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df.show
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/** 结果打印
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+-----+---+
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| name| age|
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+-----+---+
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| alice| 18|
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| bob| 14|
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+-----+---+
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*/
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```
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要想在加载的过程中,为DataFrame的每一列指定数据类型,我们需要显式地定义Data Schema,并在read API中通过调用schema方法,来将Schema传递给Spark SQL。Data Schema的定义我们讲createDataFrame函数的时候提过,咱们不妨一起来回顾一下。
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定义Schema:
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```scala
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import org.apache.spark.sql.types.{StringType, IntegerType, StructField, StructType}
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val schema:StructType = StructType( Array(
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StructField("name", StringType),
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StructField("age", IntegerType)
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))
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```
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调用schema方法来传递Data Schema:
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```scala
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val csvFilePath: String = _
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val df: DataFrame = spark.read.format("csv").schema(schema).option("header", true).load(csvFilePath)
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||
// df: org.apache.spark.sql.DataFrame = [name: string, age: int]
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```
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可以看到,在使用schema方法明确了Data Schema以后,数据加载完成之后创建的DataFrame类型由原来的“\[name: string, age: string\]”,变为“\[name: string, age: int\]”。需要注意的是,**并不是所有文件格式都需要schema方法来指定Data Schema**,因此在read API的一般用法中,schema方法并不是必需环节。
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![图片](https://static001.geekbang.org/resource/image/52/43/525441865dede68fa5a9138cb930de43.jpg?wh=1920x654 "read API的一般用法")
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好,我们接着说CSV格式的option选项。在“header”之后,第二个选项是“seq”,它是用于分隔列数据的分隔符,可以是任意字符串,默认值是逗号。常见的分隔符还有Tab、“|”,等等。
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之后的“escape”和“nullValue”分别用于指定文件中的转义字符和空值,而“dateFormat”则用于指定日期格式,它的设置值是任意可以转换为Java SimpleDateFormat类型的字符串,默认值是“yyyy-MM-dd”。
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最后一个选项是“mode”,它用来指定文件的读取模式,更准确地说,它明确了Spark SQL应该如何对待CSV文件中的“脏数据”。
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所谓脏数据,它指的是数据值与预期数据类型不符的数据记录。比如说,CSV文件中有一列名为“age”数据,它用于记录用户年龄,数据类型为整型Int。那么显然,age列数据不能出现像“8.5”这样的小数、或是像“8岁”这样的字符串,这里的“8.5”或是“8岁”就是我们常说的脏数据。
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在不调用schema方法来显示指定Data Schema的情况下,Spark SQL将所有数据列都看作是String类型。我们不难发现,mode选项的使用,往往会与schema方法的调用如影随形。
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mode支持3个取值,分别是permissive、dropMalformed和failFast,它们的含义如下表所示。
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![图片](https://static001.geekbang.org/resource/image/ca/af/ca8e9d19dc596b5e61b6f2bccdyy84af.jpg?wh=1920x717 "mode取值与含义")
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可以看到,除了“failFast”模式以外,另外两个模式都不影响DataFrame的创建。以下面的CSV文件为例,要想剔除脏数据,也就是“cassie, six”这条记录,同时正常加载满足类型要求的“干净”数据,我们需要同时结合schema方法与mode选项来实现。
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CSV文件内容:
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```scala
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name,age
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alice,18
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bob,14
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cassie, six
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```
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调用schema方法来传递Data Schema:
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```scala
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val csvFilePath: String = _
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val df: DataFrame = spark.read.format("csv")
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.schema(schema)
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.option("header", true)
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.option("mode", "dropMalformed")
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.load(csvFilePath)
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// df: org.apache.spark.sql.DataFrame = [name: string, age: int]
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df.show
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/** 结果打印
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+-----+---+
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| name| age|
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+-----+---+
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| alice| 18|
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| bob| 14|
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||
+-----+---+
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||
*/
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```
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好啦,关于从CSV文件创建DataFrame,我们就讲完了。不难发现,从CSV创建DataFrame,过程相对比较繁琐,开发者需要注意的细节也很多。不过,毕竟CSV简单直接、跨平台、可读性好、应用广泛,因此掌握这部分开发技巧,还是非常值得的。
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### 从Parquet / ORC创建DataFrame
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接下来,我们就来说说Parquet格式和ORC格式,相比从CSV创建DataFrame,这两个方法就没那么麻烦了。
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Parquet与ORC,都是应用广泛的列存(Column-based Store)文件格式。顾名思义,列存,是相对行存(Row-based Store)而言的。
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在传统的行存文件格式中,数据记录以行为单位进行存储。虽然这非常符合人类的直觉,但在数据的检索与扫描方面,行存数据往往效率低下。例如,在数据探索、数据分析等数仓应用场景中,我们往往仅需扫描数据记录的某些字段,但在行存模式下,我们必须要扫描全量数据,才能完成字段的过滤。
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CSV就是典型的行存数据格式,以如下的内容为例,如果我们想要统计文件中女生的数量,那么我们不得不扫描每一行数据,判断gender的取值,然后才能决定是否让当前记录参与计数。
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CSV文件内容:
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```plain
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name,age,gender
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alice,18,female
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bob,14,male
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```
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列存文件则不同,它以列为单位,对数据进行存储,每一列都有单独的文件或是文件块。还是以上面的文件内容为例,如果采用列存格式的话,那么文件的存储方式将会变成下面的样子。
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![图片](https://static001.geekbang.org/resource/image/6b/0e/6b97ae414a1ea55e18018b8b056b260e.jpg?wh=1920x880 "列存文件格式示意图")
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可以看到,数据按列存储,想要统计女生的数量,我们只需扫描gender列的数据文件,而不必扫描name与age字段的数据文件。相比行存,列存有利于大幅削减数据扫描所需的文件数量。
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不仅如此,对于每一个列存文件或是文件块,列存格式往往会附加header和footer等数据结构,来记录列数据的统计信息,比如最大值、最小值、记录统计个数,等等。这些统计信息会进一步帮助提升数据访问效率,例如,对于max=“male”同时min=“male”的gender文件来说,在统计女生计数的时候,我们完全可以把这样的文件跳过,不进行扫描。
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再者,很多列存格式往往在文件中记录Data Schema,比如Parquet和ORC,它们会利用Meta Data数据结构,来记录所存储数据的数据模式。这样一来,在读取类似列存文件时,我们无需再像读取CSV一样,去手工指定Data Schema,这些繁琐的步骤都可以省去。因此,使用read API来读取Parquet或是ORC文件,就会变得非常轻松,如下所示。
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使用read API读取Parquet文件:
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```scala
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val parquetFilePath: String = _
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val df: DataFrame = spark.read.format("parquet").load(parquetFilePath)
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```
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使用read API读取ORC文件:
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```scala
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val orcFilePath: String = _
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val df: DataFrame = spark.read.format("orc").load(orcFilePath)
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```
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可以看到,在read API的用法中,我们甚至不需要指定任何option,只要有format和load这两个必需环节即可。是不是非常简单?
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好啦,到此为止,我们梳理了如何从文件系统,在不同的数据格式下创建DataFrame。在这一讲的最后,我们再来简单地了解一下如何从关系型数据库创建DataFrame,毕竟,这个场景在我们日常的开发中还是蛮常见的。
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## 从RDBMS创建DataFrame
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使用read API读取数据库,就像是使用命令行连接数据库那么简单。而使用命令行连接数据库,我们往往需要通过参数来指定数据库驱动、数据库地址、用户名、密码等关键信息。read API也是一样,只不过,这些参数通通由option选项来指定,以MySQL为例,read API的使用方法如下。
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使用read API连接数据库并创建DataFrame:
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```scala
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spark.read.format("jdbc")
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.option("driver", "com.mysql.jdbc.Driver")
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.option("url", "jdbc:mysql://hostname:port/mysql")
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.option("user", "用户名")
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.option("password","密码")
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.option("numPartitions", 20)
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.option("dbtable", "数据表名 ")
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.load()
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```
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访问数据库,我们同样需要format方法来指定“数据源格式”,这里的关键字是“jdbc”。请注意,由于数据库URL通过option来指定,因此调用load方法不再需要传入“文件路径”,我们重点来关注option选项的设置。
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与命令行一样,option选项同样需要driver、url、user、password这些参数,来指定数据库连接的常规设置。不过,毕竟调用read API的目的是创建DataFrame,因此,我们还需要指定“dbtable”选项来确定要访问哪个数据表。
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有意思的是,除了将表名赋值给“dbtable”以外,我们还可以把任意的SQL查询语句赋值给该选项,这样在数据加载的过程中就能完成数据过滤,提升访问效率。例如,我们想从users表选出所有的女生数据,然后在其上创建DataFrame。
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```scala
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val sqlQuery: String = “select * from users where gender = ‘female’”
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||
spark.read.format("jdbc")
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.option("driver", "com.mysql.jdbc.Driver")
|
||
.option("url", "jdbc:mysql://hostname:port/mysql")
|
||
.option("user", "用户名")
|
||
.option("password","密码")
|
||
.option("numPartitions", 20)
|
||
.option("dbtable", sqlQuery)
|
||
.load()
|
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||
```
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此外,为了提升后续的并行处理效率,我们还可以通过“numPartitions”选项来控制DataFrame的并行度,也即DataFrame的Partitions数量。
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需要额外注意的是,在默认情况下,Spark安装目录并没有提供与数据库连接有关的任何Jar包,因此,对于想要访问的数据库,不论是MySQL、PostgreSQL,还是Oracle、DB2,我们都需要把相关Jar包手工拷贝到Spark安装目录下的Jars文件夹。与此同时,我们还要在spark-shell命令或是spark-submit中,通过如下两个命令行参数,来告诉Spark相关Jar包的访问地址。
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* –driver-class-path mysql-connector-java-version.jar
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* –jars mysql-connector-java-version.jar
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好啦,到此为止,这一讲的内容就全部讲完啦!今天的内容有点多,我们来一起总结一下。
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## 重点回顾
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今天这一讲,我们聚焦在DataFrame的创建方式上。Spark支持种类丰富的数据源与数据格式,我们今天的重点,是通过Driver、文件系统和关系型数据库,来创建DataFrame。
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在Driver端,我们可以使用createDataFrame方法来创建DataFrame,需要注意的是,这种创建方式有两个前提条件。**一是底层RDD的类型必须是RDD\[Row\],二是我们需要手工创建Data Schema**。Schema的创建需要用到StructType、StructField等数据类型,你要牢记在心。
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```scala
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import org.apache.spark.sql.types.{StringType, IntegerType, StructField, StructType}
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||
val schema:StructType = StructType( Array(
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StructField("name", StringType),
|
||
StructField("age", IntegerType)
|
||
))
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```
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除了这种比较繁琐的方式之外,我们还可以利用spark.implicits.\_提供的隐式方法,通过在RDD或是原始序列数据之上调用toDF方法,轻松创建DataFrame。
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接着,使用SparkSession的read API,我们分别讲解了从CSV、Parquet、ORC和关系型数据库创建DataFrame的一般方法。read API调用的一般方法,需要你熟练掌握。
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![图片](https://static001.geekbang.org/resource/image/52/43/525441865dede68fa5a9138cb930de43.jpg?wh=1920x654 "read API的一般用法")
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由于Parquet、ORC这类列存格式在文件中内置了Data Schema,因此,访问这类文件格式,只有format和load两个方法是必需的。
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相比之下,读取CSV较为复杂。首先,为了指定Data Schema,开发者需要额外通过schema方法,来输入预定义的数据模式。再者,CSV的option选项比较多,你可以参考后面的表格,来更好地控制CSV数据的加载过程。
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![图片](https://static001.geekbang.org/resource/image/ba/7d/baa646d5c88322e88376d905573f4a7d.jpg?wh=1920x943 "CSV格式常用的option选项")
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最后,我们学习了read API访问RDBMS的一般方法。与命令行的访问方式类似,你需要通过多个option选项,来指定数据库连接所必需的访问参数,如数据库驱动、URL地址、用户名、密码,等等。特别地,你还可以为“dbtable”选项指定表名或是查询语句,对数据的加载过程进行干预和控制。
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## 每课一练
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给定如下CSV文件,请你分别使用permissive, dropMalformed, failFast这3种mode,对比read API所创建的DataFrame之间的区别。
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```verilog
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name,age
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alice,18
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bob,14
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cassie, six
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```
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欢迎你在留言区跟我交流活动,也推荐你把这一讲的内容分享给更多的同事、朋友,跟他一起学习进步。
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