# 23 | 数字计算:介绍线性代数和数值计算库 你好,我是吴咏炜。 科学计算在今天已经完全可以使用 C++ 了。我不是从事科学计算这一领域的工作的,不过,在工作中也多多少少接触到了一些计算相关的库。今天,我就给你介绍几个有用的计算库。 ## Armadillo 说到计算,你可能首先会想到矩阵、矢量这些东西吧?这些计算,确实就是科学计算中的常见内容了。这些领域的标准,即是一些 Fortran 库定下的,如: * BLAS \[1\] * LAPACK \[2\] * ARPACK \[3\] 它们的实现倒不一定用 Fortran,尤其是 BLAS: * OpenBLAS \[4\] 是用汇编和 C 语言写的 * Intel MKL \[5\] 有针对 Intel 的特定 CPU 指令集进行优化的汇编代码 * Mir GLAS \[6\] 是用 D 语言写的 不管实现的方法是哪一种,暴露出来的函数名字是这个样子的: * `ddot` * `dgemv` * `dsyrk` * `sgemm` * …… 这个接口的唯一好处,应该就是,它是跨语言并且跨实现的😅。所以,使用这些函数时,你可以切换不同的实现,而不需要更改代码。唯一需要修改的,通常就是链接库的名字或位置而已。 假设我们需要做一个简单的矩阵运算,对一个矢量进行旋转: $$ \\begin{aligned} \\mathbf{P} &= \\begin{bmatrix} 1 \\\\\\ 0 \\end{bmatrix}\\\\\\ \\mathbf{R} &= \\begin{bmatrix} \\cos(\\theta) & -\\sin(\\theta) \\\\\\ \\sin(\\theta) & \\cos(\\theta)\\end{bmatrix}\\\\\\ \\mathbf{P^\\prime} &= \\mathbf{R} \\cdot \\mathbf{P} \\end{aligned} $$ 这么一个简单的操作,用纯 C 接口的 BLAS 来表达,有点痛苦:你需要使用的大概是 `dgemv_` 函数,而这个函数需要 11 个参数!我查阅了一下资料之后,也就放弃了给你展示一下如何调用 `dgemv_` 的企图,我们还是老老实实地看一下在现代 C++ 里的写法吧: ```c++ #include #include #include using namespace std; int main() { // 代表位置的向量 arma::vec pos{1.0, 0.0}; // 旋转矩阵 auto& pi = arma::datum::pi; double angle = pi / 2; arma::mat rot = { {cos(angle), -sin(angle)}, {sin(angle), cos(angle)}}; cout << "Current position:\n" << pos; cout << "Rotating " << angle * 180 / pi << " deg\n"; arma::vec new_pos = rot * pos; cout << "New position:\n" << new_pos; } ``` 这就是使用 Armadillo \[7\] 库来实现矢量旋转的代码。这个代码,基本就是上面的数学公式的一一对应了。代码相当直白,我只需要稍稍说明一下: * 所有的 Armadillo 的类型和函数都定义在 `arma` 名空间下。 * Armadillo 在 `arma::datum` 下定义了包括 pi 和 e 在内的一些数学常量。 * `vec` 是矢量类型,`mat` 是矩阵类型,这两个类型实际上是 `Col` 和 `Mat` 的缩写别名。 * Armadillo 支持使用 C++11 的列表初始化语法来初始化对象。 * Armadillo 支持使用流来输出对象。 上面代码的输出为: > `Current position:` > `1.0000` > `0` > `Rotating 90 deg` > `New position:` > `6.1232e-17` > `1.0000e+00` 输出里面的 `6.1232e-17` 是浮点数表示不精确的后果,把它理解成 0 就对了。 我们上面已经提到了 `vec` 实际上是 `Col`,双精度浮点数类型的列矢量。自然,Armadillo 也有行矢量 `rowvec`(即 `Row`),也可以使用其他的数字类型,如 `int`、 `float` 和 `complex`。此外,除了大小不确定的线性代数对象之外,Armadillo 也提供了固定大小的子类型,如 `vec::fixed<2>` 和 `mat::fixed<2, 2>`;为方便使用,还提供了不少别名,如 `imat22` 代表 `Mat::fixed<2, 2>` 等。固定大小的对象不需要动态内存分配,使用上有一定的性能优势。 Armadillo 是一个非常复杂的库,它的头文件数量超过了 500 个。我们今天不可能、也不必要描述它的所有功能,只能稍稍部分列举一下: * 除了目前提到的列矢量、行矢量和矩阵外,Armadillo 也支持三维的数据立方体,`Cube` 模板。 * Armadillo 支持稀疏矩阵,`SpMat` 模板。 * 除了数学上的加、减、乘运算,Armadillo 支持按元素的乘法、除法、相等、不等、小于比较等(使用 `%`、`/`、`==`、`!=`、`<` 等)运算,结果的大小跟参数相同,每个元素是相应运算的结果。某些运算符可能不太直观,尤其是 `%`(不是取模)和 `==`(返回不是单个布尔值,而是矩阵)。 * Armadillo 支持对非固定大小的矢量、矩阵和立方体,改变其大小(`.reshape()` 和 `resize()`)。 * Armadillo 可以方便地按行(`.col()`)、列(`.row()`)、对角线(`.diag()`)读写矩阵的内容,包括用一个矢量去改写矩阵的对角线。 * Armadillo 可以方便地对矩阵进行转置(`.t()`)、求反(`.inv()`)。 * Armadillo 可以对矩阵进行特征分解(`eigen_sym()`、`eigen_gen()` 等)。 * Armadillo 支持傅立叶变换(`fft()`、`fft2()` 等)。 * Armadillo 支持常见的统计计算,如平均值、中位值、标准偏差等(`mean()`、`median()`、`stddev()` 等)。 * Armadillo 支持多项式方程求根(`roots`)。 * Armadillo 支持 k‐平均聚类(_k_\-means clustering)算法(`kmeans`)。 * 等等。 如果你需要用到这些功能,你可以自己去查看一下具体的细节,我们这儿只提几个与编程有关的细节。 ### 对象的输出 我们上面已经展示了直接把对象输出到一个流。我们的写法是: ```c++ cout << "Current position:\n" << pos; ``` 实际上基本等价于调用 `print` 成员函数: ```c++ pos.print("Current position:"); ``` 这个写法可能会更简单些。此外,在这两种情况,输出的格式都是 Armadillo 自动控制的。如果你希望自己控制的话,可以使用 `raw_print` 成员函数。比如,对于上面代码里对 `new_pos` 的输出,我们可以写成(需要包含 ): ```c++ cout << fixed << setw(9) << setprecision(4); new_pos.raw_print( cout, "New position:"); ``` 这种情况下,你可以有效地对格式、宽度和精度进行设置,能得到: > `New position:` > `0.0000` > `1.0000` 记得我们说过 `vec` 是 `Col` 的别名,因此输出是多行的。我们要输出成单行的话,转置(transpose)一下就可以了: ```c++ cout << fixed << setw(9) << setprecision(4); new_pos.t().raw_print( cout, "New position:"); ``` 输出为: > `New position:` > `0.0000 1.0000` ### 表达式模板 如果你奇怪前面 `dgemv_` 为什么有 11 个参数,这里有个我没有提的细节是,它执行的实际上是个复合操作: $$ \\mathbf{y} \\gets \\alpha\\mathbf{A}\\cdot\\mathbf{x} + \\beta\\mathbf{y} $$ 如果你只是简单地做乘法的话,就相当于 $\\alpha$ 为 1、$\\beta$ 为 0 的特殊情况。那么问题来了,如果你真的写了类似于上面这样的公式的话,编译器和线性代数库能不能转成合适的调用、而没有额外的开销呢? 答案是,至少在某些情况下是可以的。秘诀就是表达式模板(expression template)\[8\]。 那什么是表达式模板呢?我们先回过去看我上面的例子。有没有注意到我写的是: ```c++ arma::vec new_pos = rot * pos; ``` 而没有使用 `auto` 来声明? 其中部分的原因是,`rot * pos` 的类型并不是 `vec`,而是: ```c++ const Glue, Col, glue_times> ``` 换句话说,结果是一个表达式,而并没有实际进行计算。如果我用 `auto` 的话,行为上似乎一切都正常,但我每次输出这个结果时,都会重新进行一次矩阵的乘法!而我用 `arma::vec` 接收的话,构造时就直接进行了计算,存储了表达式的结果。 上面的简单例子不能实际触发对 `dgemv_` 的调用,我用下面的代码实际验证出了表达式模板产生的优化(`fill::randu` 表示对矢量和矩阵的内容进行随机填充): ```c++ #include #include using namespace std; using namespace arma; int main() { vec x(8, fill::randu); mat r(8, 8, fill::randu); vec result = 2.5 * r * x; cout << result; } ``` 赋值语句右边的类型是: ```c++ const Glue, eop_scalar_times>, Col, glue_times> ``` 当使用这个表达式构造 `vec` 时,就会实际发生对 `dgemv_` 的调用。我也确实跟踪到了,在将要调用 `dgemv_` 时,标量值 2.5 确实在参数 `alpha` 指向的位置上(这个接口的参数都是指针)。 从上面的描述可以看到,表达式模板是把双刃剑:既可以提高代码的性能,又能增加代码被误用的可能性。在可能用到表达式模板的地方,你需要注意这些问题。 ### 平台细节 Armadillo 的文档里说明了如何从源代码进行安装,但在 Linux 和 macOS 下通过包管理器安装可能是更快的方式。在 CentOS 下可使用 `sudo yum install armadillo-devel`,在 macOS 下可使用 `brew install armadillo`。使用包管理器一般也会同时安装常见的依赖软件,如 ARPACK 和 OpenBLAS。 在 Windows 上,Armadillo 的安装包里自带了一个基本版本的 64 位 BLAS 和 LAPACK 库。如果需要更高性能或 32 位版本的话,就需要自己另外去安装了。除非你只是做一些非常简单的线性代数计算(就像我今天的例子),那直接告诉 Armadillo 不要使用第三方库也行。 > `cl /EHsc /DARMA_DONT_USE_BLAS /DARMA_DONT_USE_LAPACK …` ## Boost.Multiprecision 众所周知,C 和 C++(甚至推而广之到大部分的常用编程语言)里的数值类型是有精度限制的。比如,上一讲的代码里我们就用到了 `INT_MIN`,最小的整数。很多情况下,使用目前这些类型是够用的(最高一般是 64 位整数和 80 位浮点数)。但也有很多情况,这些标准的类型远远不能满足需要。这时你就需要一个高精度的数值类型了。 有一次我需要找一个高精度整数类型和计算库,最后找到的就是 Boost.Multiprecision \[9\]。它基本满足我的需求,以及一般意义上对库的期望: * 正确实现我需要的功能 * 接口符合直觉、易用 * 有良好的性能 正确实现功能这点我就不多讲了。这是一个基本出发点,没有太多可讨论的地方。在我上次的需求里,对性能其实也没有很高的要求。让我对 Boost.Multiprecision 满意的主要原因,就是它的接口了。 ### 接口易用性 我在[\[第 12 讲\]](https://time.geekbang.org/column/article/179363) 提到了 CLN。它对我来讲就是个反面教材。它的整数类型不仅不提供 `%` 运算符,居然还不提供 `/` 运算符!它强迫用户在下面两个方案中做出选择: * 使用 `truncate2` 函数,得到一个商数和余数 * 使用 `exquo` 函数,当且仅当可以整除的时候 不管作者的设计原则是什么,这简直就是易用性方面的灾难了——不仅这些函数要查文档才能知晓,而且有的地方我真的只需要简单的除法呀…… 哦,对了,它在 Windows 编译还很不方便,而我那时用的正是 Windows。 Boost.Multiprecision 的情况则恰恰相反,让我当即大为满意: * 使用基本的 `cpp_int` 对象不需要预先编译库,只需要 Boost 的头文件和一个好的编译器。 * 常用运算符 `+`、`-`、`*`、`/`、`%` 一个不缺,全部都有。 * 可以自然地通过整数和字符串来进行构造。 * 提供了用户自定义字面量来高效地进行初始化。 * 在使用 IO 流时,输入输出既可以使用十进制,也可以通过 `hex` 来切换到十六进制。 下面的代码展示了它的基本功能: ```c++ #include #include #include using namespace std; int main() { using namespace boost:: multiprecision::literals; using boost::multiprecision:: cpp_int; cpp_int a = 0x123456789abcdef0_cppi; cpp_int b = 16; cpp_int c{"0400"}; cpp_int result = a * b / c; cout << hex << result << endl; cout << dec << result << endl; } ``` 输出是: > `123456789abcdef` > `81985529216486895` 我们可以看到,`cpp_int` 可以通过自定义字面量(后缀 `_cppi`;只能十六进制)来初始化,可以通过一个普通整数来初始化,也可以通过字符串来初始化(并可以使用 `0x` 和 `0` 前缀来选择十六进制和八进制)。拿它可以正常地进行加减乘除操作,也可以通过 IO 流来输入输出。 ### 性能 Boost.Multiprecision 使用了表达式模板和 C++11 的移动来避免不必要的拷贝。后者当然是件好事,而前者曾经坑了我一下——我第一次使用 Boost.Multiprecision 时非常困惑为什么我使用 `half(n - 1)` 调用下面的简单函数居然会编译不过: ```c++ template inline N half(N n) { return n / 2; } ``` 我的意图当然是 `N` 应当被推导为 `cpp_int`,`half` 的结果也是 `cpp_int`。可实际上,`n - 1` 的结果跟上面的 Armadillo 展示的情况类似,是另外一个单独的类型。我需要把 `half(n - 1)` 改写成 `half(N(n - 1))` 才能得到期望的结果。 我做的计算挺简单,并不觉得表达式模板对我的计算有啥帮助,所以我最后是禁用了表达式模板: ```c++ typedef boost::multiprecision:: number< boost::multiprecision:: cpp_int_backend<>, boost::multiprecision::et_off> int_type; ``` 类似于 Armadillo 可以换不同的 BLAS 和 LAPACK 实现,Boost.Multiprecision 也可以改换不同的后端。比如,如果我们打算使用 GMP \[10\] 的话,我们需要包含利用 GMP 的头文件,并把上面的 `int_type` 的定义修正一下: ```c++ #include typedef boost::multiprecision:: number< boost::multiprecision::gmp_int, boost::multiprecision::et_off> int_type; ``` 注意,我并不是推荐你换用 GMP。如果你真的对性能非常渴求的话,应当进行测试来选择合适的后端。否则缺省的后端易用性最好——比如,使用 GMP 后端就不能使用自定义字面量了。 我当时寻找高精度算术库是为了做 RSA 加解密。计算本身不复杂,属于编程几小时、运行几毫秒的情况。如果你有兴趣的话,可以看一下我那时的挑选过程和最终代码 \[11\]。 Boost 里好东西很多,远远不止这一样。下一讲我们就来专门聊聊 Boost。 ## 内容小结 本讲我们讨论了两个进行计算的模板库,Armadillo 和 Boost.Multiprecision,并讨论了它们用到的表达式模板技巧和相关的计算库,如 BLAS、LAPACK 和 GMP。可以看到,使用 C++ 你可以站到巨人肩上,轻松写出高性能的计算代码。 ## 课后思考 性能和易用性往往是有矛盾的。你对性能和易用性有什么样的偏好呢?欢迎留言与我分享。 ## 参考资料 \[1\] Wikipedia, “Basic Linear Algebra Subprograms”. [https://en.wikipedia.org/wiki/Basic\_Linear\_Algebra\_Subprograms](https://en.wikipedia.org/wiki/Basic_Linear_Algebra_Subprograms) \[2\] Wikipedia, “LAPACK”. [https://en.wikipedia.org/wiki/LAPACK](https://en.wikipedia.org/wiki/LAPACK) \[3\] Wikipedia, “ARPACK”. [https://en.wikipedia.org/wiki/ARPACK](https://en.wikipedia.org/wiki/ARPACK) \[4\] Zhang Xianyi et al., OpenBLAS. [https://github.com/xianyi/OpenBLAS](https://github.com/xianyi/OpenBLAS) \[5\] Intel, Math Kernel Library. [https://software.intel.com/mkl](https://software.intel.com/mkl) \[6\] Ilya Yaroshenko, mir-glas. [https://github.com/libmir/mir-glas](https://github.com/libmir/mir-glas) \[7\] Conrad Sanderson and Ryan Curtin, “Armadillo: C++ library for linear algebra & scientific computing”. [http://arma.sourceforge.net/](http://arma.sourceforge.net/) \[8\] Wikipedia, “Expression templates”. [https://en.wikipedia.org/wiki/Expression\_templates](https://en.wikipedia.org/wiki/Expression_templates) \[9\] John Maddock, Boost.Multiprecision. [https://www.boost.org/doc/libs/release/libs/multiprecision/doc/html/index.html](https://www.boost.org/doc/libs/release/libs/multiprecision/doc/html/index.html) \[10\] The GNU MP bignum library. [https://gmplib.org/](https://gmplib.org/) \[11\] 吴咏炜, “Choosing a multi-precision library for C++—a critique”. [https://yongweiwu.wordpress.com/2016/06/04/choosing-a-multi-precision-library-for-c-a-critique/](https://yongweiwu.wordpress.com/2016/06/04/choosing-a-multi-precision-library-for-c-a-critique/)