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2 years ago
# 14 | 容器中的内存与I/O容器写文件的延时为什么波动很大
你好,我是程远。这一讲,我们继续聊一聊容器中写文件性能波动的问题。
你应该还记得,我们[上一讲](https://time.geekbang.org/column/article/320123)中讲过Linux中的两种I/O模式Direct I/O和Buffered I/O。
对于Linux的系统调用write()来说Buffered I/O是缺省模式使用起来比较方便而且从用户角度看在大多数的应用场景下用Buffered I/O的write()函数调用返回要快一些。所以Buffered I/O在程序中使用得更普遍一些。
当使用Buffered I/O的应用程序从虚拟机迁移到容器这时我们就会发现多了Memory Cgroup的限制之后write()写相同大小的数据块花费的时间,延时波动会比较大。
这是怎么回事呢?接下来我们就带着问题开始今天的学习。
## 问题再现
我们可以先动手写一个[小程序](https://github.com/chengyli/training/blob/master/filesystem/writeback/bin/test_iowrite),用来模拟刚刚说的现象。
这个小程序我们这样来设计从一个文件中每次读取一个64KB大小的数据块然后写到一个新文件中它可以不断读写10GB大小的数据。同时我们在这个小程序中做个记录记录写每个64KB的数据块需要花费的时间。
我们可以先在虚拟机里直接运行虚拟机里内存大小是大于10GB的。接着我们把这个程序放到容器中运行因为这个程序本身并不需要很多的内存我们给它做了一个Memory Cgroup的内存限制设置为1GB。
运行结束后我们比较一下程序写数据块的时间。我把结果画了一张图图里的纵轴是时间单位us横轴是次数在这里我们记录了96次。图中橘红色的线是在容器里运行的结果蓝色的线是在虚拟机上运行的结果。
结果很明显在容器中写入数据块的时间会时不时地增高到200us而在虚拟机里的写入数据块时间就比较平稳一直在3050us这个范围内。
![](https://static001.geekbang.org/resource/image/7c/c0/7c494f4bc587b618f4b7db3db9ce4ac0.jpg)
通过这个小程序,我们再现了问题,那我们就来分析一下,为什么会产生这样的结果。
## 时间波动是因为Dirty Pages的影响么
我们对文件的写入操作是Buffered I/O。在前一讲中我们其实已经知道了对于Buffer I/O用户的数据是先写入到Page Cache里的。而这些写入了数据的内存页面在它们没有被写入到磁盘文件之前就被叫作dirty pages。
Linux内核会有专门的内核线程每个磁盘设备对应的kworker/flush 线程把dirty pages写入到磁盘中。那我们自然会这样猜测也许是Linux内核对dirty pages的操作影响了Buffered I/O的写操作
想要验证这个想法我们需要先来看看dirty pages是在什么时候被写入到磁盘的。这里就要用到**/proc/sys/vm里和dirty page相关的内核参数**了,我们需要知道所有相关参数的含义,才能判断出最后真正导致问题发生的原因。
现在我们挨个来看一下。为了方便后面的讲述我们可以设定一个比值A**A等于dirty pages的内存/节点可用内存\*100%**。
第一个参数dirty\_background\_ratio这个参数里的数值是一个百分比值缺省是10%。如果比值A大于dirty\_background\_ratio的话比如大于默认的10%内核flush线程就会把dirty pages刷到磁盘里。
第二个参数是和dirty\_background\_ratio相对应一个参数也就是dirty\_background\_bytes它和dirty\_background\_ratio作用相同。区别只是dirty\_background\_bytes是具体的字节数它用来定义的是dirty pages内存的临界值而不是比例值。
这里你还要注意dirty\_background\_ratio和 dirty\_background\_bytes只有一个可以起作用如果你给其中一个赋值之后另外一个参数就归0了。
接下来我们看第三个参数dirty\_ratio这个参数的数值也是一个百分比值缺省是20%。
如果比值A大于参数dirty\_ratio的值比如大于默认设置的20%这时候正在执行Buffered I/O写文件的进程就会被阻塞住直到它写的数据页面都写到磁盘为止。
同样第四个参数dirty\_bytes与dirty\_ratio相对应它们的关系和dirty\_background\_ratio与dirty\_background\_bytes一样。我们给其中一个赋值后另一个就会归零。
然后我们来看dirty\_writeback\_centisecs这个参数的值是个时间值以百分之一秒为单位缺省值是500也就是5秒钟。它表示每5秒钟会唤醒内核的flush线程来处理dirty pages。
最后还有dirty\_expire\_centisecs这个参数的值也是一个时间值以百分之一秒为单位缺省值是3000也就是30秒钟。它定义了dirty page在内存中存放的最长时间如果一个dirty page超过这里定义的时间那么内核的flush线程也会把这个页面写入磁盘。
好了从这些dirty pages相关的参数定义你会想到些什么呢
进程写操作上的时间波动只有可能是因为dirty pages的数量很多已经达到了第三个参数dirty\_ratio的值。这时执行写文件功能的进程就会被暂停直到写文件的操作将数据页面写入磁盘写文件的进程才能继续运行所以进程里一次写文件数据块的操作时间会增加。
刚刚说的是我们的推理那情况真的会是这样吗其实我们可以在容器中进程不断写入数据的时候查看节点上dirty pages的实时数目。具体操作如下
```shell
watch -n 1 "cat /proc/vmstat | grep dirty"
```
当我们的节点可用内存是12GB的时候假设dirty\_ratio是20%dirty\_background\_ratio是10%那么我们在1GB memory容器中写10GB的数据就会看到它实时的dirty pages数目也就是/ proc/vmstat里的nr\_dirty的数值这个数值对应的内存并不能达到dirty\_ratio所占的内存值。
![](https://static001.geekbang.org/resource/image/cc/68/ccd0b41e3bd9420c539942b84d88f968.png)
其实我们还可以再做个实验就是在dirty\_bytes和dirty\_background\_bytes里写入一个很小的值。
```shell
echo 8192 > /proc/sys/vm/dirty_bytes
echo 4096 > /proc/sys/vm/dirty_background_bytes
```
然后再记录一下容器程序里每写入64KB数据块的时间这时候我们就会看到时不时一次写入的时间就会达到9ms这已经远远高于我们之前看到的200us了。
因此我们知道了这个时间的波动并不是强制把dirty page写入到磁盘引起的。
## 调试问题
那接下来,我们还能怎么分析这个问题呢?
我们可以用perf和ftrace这两个工具对容器里写数据块的进程做个profile看看到底是调用哪个函数花费了比较长的时间。顺便说一下我们在专题加餐里会专门介绍如何使用perf、ftrace等工具以及它们的工作原理在这里你只要了解我们的调试思路就行。
怎么使用这两个工具去定位耗时高的函数呢我大致思路是这样的我们发现容器中的进程用到了write()这个函数调用然后写64KB数据块的时间增加了而write()是一个系统调用,那我们需要进行下面这两步操作。
**第一步我们要找到内核中write()这个系统调用函数下,又调用了哪些子函数。**想找出主要的子函数我们可以查看代码也可以用perf这个工具来得到。
然后是**第二步得到了write()的主要子函数之后我们可以用ftrace这个工具来trace这些函数的执行时间这样就可以找到花费时间最长的函数了。**
下面我们就按照刚才梳理的思路来做一下。首先是第一步我们在容器启动写磁盘的进程后在宿主机上得到这个进程的pid然后运行下面的perf命令。
```
perf record -a -g -p <pid>
```
等写磁盘的进程退出之后这个perf record也就停止了。
这时我们再执行 `perf report` 查看结果。把vfs\_write()函数展开之后我们就可以看到write()这个系统调用下面的调用到了哪些主要的子函数,到这里第一步就完成了。
![](https://static001.geekbang.org/resource/image/91/9d/9191caa5db8c0afe2363540bc31e1d9d.png)
下面再来做第二步我们把主要的函数写入到ftrace的set\_ftrace\_filter里然后把ftrace的tracer设置为function\_graph并且打开tracing\_on开启追踪。
```shell
# cd /sys/kernel/debug/tracing
# echo vfs_write >> set_ftrace_filter
# echo xfs_file_write_iter >> set_ftrace_filter
# echo xfs_file_buffered_aio_write >> set_ftrace_filter
# echo iomap_file_buffered_write
# echo iomap_file_buffered_write >> set_ftrace_filter
# echo pagecache_get_page >> set_ftrace_filter
# echo try_to_free_mem_cgroup_pages >> set_ftrace_filter
# echo try_charge >> set_ftrace_filter
# echo mem_cgroup_try_charge >> set_ftrace_filter
# echo function_graph > current_tracer
# echo 1 > tracing_on
```
这些设置完成之后我们再运行一下容器中的写磁盘程序同时从ftrace的trace\_pipe中读取出追踪到的这些函数。
这时我们可以看到当需要申请Page Cache页面的时候write()系统调用会反复地调用mem\_cgroup\_try\_charge()并且在释放页面的时候函数do\_try\_to\_free\_pages()花费的时间特别长有50+us时间单位micro-seconds这么多。
```shell
1) | vfs_write() {
1) | xfs_file_write_iter [xfs]() {
1) | xfs_file_buffered_aio_write [xfs]() {
1) | iomap_file_buffered_write() {
1) | pagecache_get_page() {
1) | mem_cgroup_try_charge() {
1) 0.338 us | try_charge();
1) 0.791 us | }
1) 4.127 us | }
1) | pagecache_get_page() {
1) | mem_cgroup_try_charge() {
1) | try_charge() {
1) | try_to_free_mem_cgroup_pages() {
1) + 52.798 us | do_try_to_free_pages();
1) + 53.958 us | }
1) + 54.751 us | }
1) + 55.188 us | }
1) + 56.742 us | }
1) ! 109.925 us | }
1) ! 110.558 us | }
1) ! 110.984 us | }
1) ! 111.515 us | }
```
看到这个ftrace的结果你是不是会想到我们在容器内存[那一讲](https://time.geekbang.org/column/article/316436)中提到的Page Cahe呢
是的这个问题的确和Page Cache有关Linux会把所有的空闲内存利用起来一旦有Buffered I/O这些内存都会被用作Page Cache。
当容器加了Memory Cgroup限制了内存之后对于容器里的Buffered I/O就只能使用容器中允许使用的最大内存来做Page Cache。
**那么如果容器在做内存限制的时候Cgroup中memory.limit\_in\_bytes设置得比较小而容器中的进程又有很大量的I/O这样申请新的Page Cache内存的时候又会不断释放老的内存页面这些操作就会带来额外的系统开销了。**
## 重点总结
我们今天讨论的问题是在容器中用Buffered I/O方式写文件的时候会出现写入时间波动的问题。
由于这是Buffered I/O方式对于写入文件会先写到内存里这样就产生了dirty pages所以我们先研究了一下Linux对dirty pages的回收机制是否会影响到容器中写入数据的波动。
在这里我们最主要的是理解这两个参数,**dirty\_background\_ratio 和 dirty\_ratio**,这两个值都是相对于节点可用内存的百分比值。
**当dirty pages数量超过dirty\_background\_ratio对应的内存量的时候内核flush线程就会开始把dirty pages写入磁盘; 当dirty pages数量超过dirty\_ratio对应的内存量这时候程序写文件的函数调用write()就会被阻塞住直到这次调用的dirty pages全部写入到磁盘。**
在节点是大内存容量并且dirty\_ratio为系统缺省值20%dirty\_background\_ratio是系统缺省值10%的情况下,我们通过观察 /proc/vmstat中的nr\_dirty数值可以发现dirty pages不会阻塞进程的Buffered I/O写文件操作。
所以我们做了另一种尝试使用perf和ftrace工具对容器中的写文件进程进行profile。我们用perf得到了系统调用write()在内核中的一系列子函数调用再用ftrace来查看这些子函数的调用时间。
**根据ftrace的结果我们发现写数据到Page Cache的时候需要不断地去释放原有的页面这个时间开销是最大的。造成容器中Buffered I/O write()不稳定的原因正是容器在限制内存之后Page Cache的数量较小并且不断申请释放。**
其实这个问题也提醒了我们在对容器做Memory Cgroup限制内存大小的时候不仅要考虑容器中进程实际使用的内存量还要考虑容器中程序I/O的量合理预留足够的内存作为Buffered I/O 的Page Cache。
比如如果知道需要反复读写文件的大小并且在内存足够的情况下那么Memory Cgroup的内存限制可以超过这个文件的大小。
还有一个解决思路是我们在程序中自己管理文件的cache并且调用Direct I/O来读写文件这样才会对应用程序的性能有一个更好的预期。
## 思考题
我们对 dirty\_bytes 和 dirty\_background\_bytes做下面的设置
```shell
-bash-4.2# echo 8192 > /proc/sys/vm/dirty_bytes
-bash-4.2# echo 4096 > /proc/sys/vm/dirty_background_bytes
```
然后再运行下面的fio测试得到的结果和缺省dirty\_\*配置的时候会有差别吗?
```shell
# fio -direct=1 -iodepth=64 -rw=write -ioengine=libaio -bs=4k -size=10G -numjobs=1 -name=./fio.test
```
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